こんにちは。
おそらくですが、単に「メールが届かない」のではなく、Cloud Payment との通信に失敗していて、Welcart で受注データが作成できないのではないかと思います。 メールは、受注データを正常に作成したのを確認してから送信しています。
Cloud Payment をご利用の場合は、以下のオンラインマニュアルと、リンク先の「導入マニュアル」をダウンロードしてご参照ください。
https://goo.gl/3J46Kz
導入マニュアルの「予期せぬエラーの対処法」をご参照の上、検証してください。