投稿ありがとうございます！
ん？？まさに、uishiさんのような感じにしたいのですが、yskysmrさんがおっしゃるように、商品単位に商品オプションが付くようなので、下記のような感じになってしまうのです。
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素材A
2,000円
商品オプションA
商品オプションB
カートに入れる
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素材B
3,000円
商品オプションA
商品オプションB
カートに入れる
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これだと、素材Aでも素材Bのオプションが選べてしまうのです。
商品オプションA-1、A-2、B-1、B-2は違う内容なのですよね・・・？
すみません、よく理解できず、uishiさんの方法をもう少し詳しく教えていただけますか？