基本的に素人なので技術的には、めちゃくちゃかもしれませんが。
wc_completion_page.phpページに支払ボタンを表示する場合
welcart側での注文は「確定して」支払い完了を待ってる状態。
wc_confirm_page.phpページに支払ボタンを表示する場合
welcart側での注文は「確定していない」支払は完了しているなら、
支払ボタンの上の上記内容で注文するボタンを押させる工夫。
支払完了の通知方法、支払完了メールが届けば、
手動で処理すればいいとは思うんですが。
webhookをつかった処理なら、json形式でデータをおくってくる、
結果のステータスを送ってくる仕組みのようなので
json+wecartデフォのクレジットカード会社で検索して、
似たような会社のソースを
welcartのソースからpickupしてみてはいかがでしょうか。
えらそうな割にお役に立てなくて申し訳ない。